プレイヤーは「審神者（さにわ）」になり、人の姿になった刀剣（刀剣男士）を指揮し、歴史を改変しようとする敵集団に立ち向かいます。
刀剣男士は木炭・玉鋼・冷却材・砥石で「鍛刀」し増やしていきます。刀剣男士が揃ったらさっそく出陣です。が、その前に下準備。本作は敵から攻撃を受けると「軽傷」「中傷」「重傷」になり、最終的に「破壊」されてしまいます。
「中傷」になるとビジュアルが変化し傷ついた刀剣男士を見ることができます。傷つき苦悶の表情を浮かべる刀剣男士をじっくりと眺めたい！ でも、そのために刀剣男士が破壊されてしまっては元も子もありません。そこで重要になるのが「刀装」です。「刀装」は歩兵や騎兵を装備することで刀剣男士への攻撃を回避させる役目があります。RPGで防具を装備するイメージですね。刀装は消耗品なので、出陣前には刀装の補給を忘れずに。
攻撃を受けるとまれに「真剣必殺」モードになります。いつもより余計に脱いでいます！
